E. coli bakteria telah sering ditemui di perairan rekreasi dan kehadiran mereka digunakan untuk menunjukkan adanya pencemaran feses baru-baru ini, tetapi E. coli kehadiran mungkin tidak menunjukkan kotoran manusia. E. coli yang berlabuh di semua haiwan berdarah panas: burung dan mamalia sama. bakteria E. coli juga telah dijumpai pada ikan dan penyu. Pasir dan tanah juga pelabuhan E. coli bakteria dan beberapa strain dari E. coli telah menjadi dinaturalisasi. Beberapa daerah geografi yang boleh menyokong penduduk yang unik dari E. coli dan sebaliknya, beberapa E. coli strain kosmopolitan [2].[Sunting] Model organisma

E. coli sering digunakan sebagai model organisma dalam kajian mikrobiologi. strain Budidaya (contohnya E. coli K12) adalah menyesuaikan diri dengan baik dengan persekitaran makmal, dan, tidak seperti strain jenis liar, telah kehilangan kemampuan mereka untuk berkembang di usus. Banyak makmal strain kehilangan kemampuan mereka untuk membentuk biofilm [70] [71] Ciri-ciri ini melindungi strain jenis liar dari antibodi dan serangan kimia lain,. Tetapi memerlukan perbelanjaan besar sumber daya tenaga dan material.

Pada tahun 1946, Joshua Lederberg dan Edward Tatum pertama menggambarkan fenomena yang dikenali sebagai konjugasi bakteria menggunakan E. coli sebagai bakteria model, [72] dan masih model utama untuk mempelajari konjugasi. [Rujukan?] E. coli merupakan bahagian integral dari percubaan pertama untuk memahami genetik fag, [73] dan penyelidik awal, seperti Seymour Benzer, digunakan E. coli dan fag T4 untuk memahami topografi struktur gen [74] Sebelum. untuk kajian Benzer, itu tidak diketahui apakah gen adalah struktur yang linier, atau jika memiliki pola percabangan.

E. coli adalah salah satu organisma pertama yang mengandungi genom yang diurutkan;. Genom lengkap E. coli K12 diterbitkan oleh Science pada tahun 1997 [75]

Percubaan evolusi jangka panjang menggunakan E. coli, bermula oleh Richard Lenski pada tahun 1988, telah membolehkan pemerhatian langsung dari perubahan evolusi besar dalam makmal [76] Dalam kajian ini,. Satu penduduk E. coli tak terduga mengembangkan kemampuan untuk aerobik memetabolisme sitrat. Kapasiti ini sangat jarang berlaku di E. coli. Sebagai ketidakupayaan untuk menumbuhkan aerobik biasanya digunakan sebagai kriteria diagnostik yang boleh digunakan untuk membezakan dari yang lain E. coli, bakteria erat berkaitan seperti Salmonella, inovasi ini mungkin menandakan peristiwa spesiasi diamati di makmal.

Dengan menggabungkan teknologi nano dengan pemandangan habitat ekologi lanskap kompleks dapat dihasilkan dengan butiran pada skala nano. [77] Pada ekosistem sintetik seperti eksperimen evolusi dengan E. coli telah dilakukan dalam rangka untuk mempelajari biofizikal istimewa yang diadaptasi dalam biogeografi pulau on-cip.